Segundo Filme de três da adaptação da ROTA SAKURA de Fate/Stay Night. Quase 10 anos atrás, a batalha final da Quarta Guerra do Santo Graal causou estragos na cidade de Fuyuki e levou 500 vidas, deixando a cidade devastada. Shirou Emiya, um sobrevivente desta tragédia, aspira a se tornar um herói da justiça como seu salvador e pai adotivo, Kiritsugu Emiya. Apesar de ser apenas um estudante, Shirou é jogado na Quinta Guerra do Santo Graal quando acidentalmente vê uma batalha entre os servos na escola e convoca seu próprio servo, Saber. Quando uma misteriosa sombra começa uma farra assassina na cidade de Fuyuki, Shirou se alinha com Rin Toosaka, um colega participante da Guerra do Santo Graal, a fim de impedir a morte de inúmeras pessoas. No entanto, os sentimentos de Shirou por seu amigo próximo, Sakura Matou, o levaram mais a fundo nos segredos sombrios que cercam a guerra e as famílias rivais envolvidas.