Um veículo em fuga dirigido por Izumi Yasaka, a caminho do prédio do Departamento de Segurança Pública, é relatado pouco antes de bater no prédio. Izumi é uma conselheira que fugiu recentemente enquanto trabalhava em uma instalação de isolamento e reabilitação de criminosos latente conhecida como Santuário. Antes que os inspetores Mika Shimotsuki e Akane Tsunemori interroguem o suspeito, um pedido repentino é emitido da instalação para trazer Izumi de volta imediatamente. Interpretados como uma ordem direta do Chefe e da diretoria do Santuário, os Inspetores obedecem, mas insistem que Izumi seja escoltada de volta pessoalmente. Tsunemori pretende investigar mais com o resto da equipe do Bureau. Agora, a inspetora Shimotsuki finalmente teve a oportunidade que ela esperava - de ser a investigadora principal em um caso importante. Este caso segue Shimotsuki e sua equipe de Enforcers enquanto eles descobrem os segredos do Santuário.