Kamichama Karin é sobre uma aluna da 7° serie chamada Karin Hanazono. Seus pais e seu amado gato Shi-chan morreram recentemente, ela está recebendo notas horríveis e é forçada a morar com sua tia. Um dia, Karin encontra um jovem órfão, da mesma idade chamado Kazune Kujyou, e descobre que o anel de sua mãe tem o poder de transformá-la em uma deusa. Ela logo se junta a Kazune e sua prima Himeka. Ela e Kazune tem poderes divinos, e tem que lutar para proteger o anel de Karin e Himeka das más intenções de Kirio Karasuma (a quem Karin chama de Cara de óculos), que também é divino. O trio vai embarcar em aventuras loucas e irão em viagens ao longo do caminho. Eles também conhecem novos amigos e pessoas, como Micchi, que pode saber um monte de informações não só sobre a transformação divina dos deuses e deusas, mas também sobre o pai desaparecido de Kazune-chan …