Yukimura Chizuru é a filha de um médico que trabalha em Edo. Seu pai sai de Edo para trabalhar como médico voluntário e se muda para Quioto sem sua filha. Com o decorrer do tempo, Chizuru começa a se preocupar com a possibilidade de perder contato com seu pai, então assim ela decide ir a Quioto à procura dele. No caminho, Chizuru é atacada por criminosos e presencia uma luta entre Onis e o Shinsengumi. Após salvá-la e tomando ela em custódia, o Shinsengumi, comandando por Kondou Isami e Hijikata Toshizou, debate sobre o que fazer com ela quando eles descobrem que ela é a filha do médico a quem eles também procuram. Então eles decidem manter Chizuru no Shinsengumi e a ajudam a procurar pelo seu pai. Muitos eventos acontecem enquanto ela permanece com o Shingensumi, enquanto eles descobrem segredos misteriosos e lutam contra o Bakumatsu, Choushuu, entre outros.