Hana, uma estudante universitária trabalhadora, se apaixona por um homem misterioso que frequenta uma de suas aulas, embora ele não seja um aluno real. Como se vê, ele também não é verdadeiramente humano. Em uma noite de lua cheia, ele se transforma, revelando que é o último lobisomem vivo. Apesar disso, o amor de Hana continua forte, e os dois finalmente decidem começar uma família. Hana dá à luz dois filhos saudáveis – Ame, nascido durante a chuva, e Yuki, nascido durante a queda de neve – ambos possuindo a capacidade de se transformar em lobos, uma característica herdada de seu pai. Muito cedo, no entanto, a morte repentina de seu amante devasta a vida de Hana, deixando-a para criar uma família peculiar completamente por conta própria. O estresse de criar seus filhos selvagens em uma cidade densamente povoada, mantendo sua identidade em segredo, culmina em uma decisão de se mudar para o campo, onde ela espera que Ame e Yuki possam viver uma vida livre dos julgamentos da sociedade. Wolf Children é a emocionante história sobre os desafios de ser mãe solteira em um mundo moderno implacável.