Após a Era Edo, durante a Restauração Meiji, o governo japonês muda sua política e abre as portas para influências de países externos. Não só as inovações tecnológicas mudaram, mas agora os youkais e humanos vivem lado a lado e são tratados de forma igual no mundo humano. Cada youkai possui parte do seu poder selado e deve andar sempre com uma placa identificando que já foi cadastrado. Em meio a essas mudanças surge o Kidou Shinsegumi, um grupo especializado em manter a ordem na cidade e capturar ou punir os youkais que ainda não possuem licenças. Em contrapartida há o Tsubame Gumi que luta a favor da liberdade dos youkais e contra as normas do governo. A história se passa na cidade Kyoto e começa com o retorno de Ryuunosuke Sakamoto, de Shanghai, juntamente com o seu amigo gato-youkai Nekomaru. Ao invés de ir direto para casa, ele fica passeando pela cidade e arruma diversas confusões e maus entendidos com o pessoal da Kidou Shinsegumi. Após as confusões terem sido resolvidas, todos descobrem que Ryuunosuke nada mais é do que o filho da presidente do Shinsegumi.