No 11º ano da Era Meiji, o fim do xogunato samurai e a proibição das espadas deixaram o Japão com cicatrizes duradouras. Descontentes com essas mudanças recentes, muitos ex-samurais conspiram contra o novo governo, incitando uma onda de derramamento de sangue. Para combater esse movimento, o governo constrói uma prisão colossal no meio do Lago Biwa. Designado extraoficialmente para ajudar a polícia a prender criminosos, Tenka Kumou também serve como barqueiro para a prisão do Lago Biwa com a ajuda de seus dois irmãos mais novos: o ambicioso Soramaru e o entusiasmado Chuutarou. Juntamente com o ex-ninja fuma Shirasu Kinjou, os irmãos Kumou vivem uma vida frugal e alegre, principalmente dedicada ao estudo e treinamento. No entanto, por trás dessa rotina diária relativamente tranquila, o espectro da maldição "Orochi" está começando a espalhar sua sombra sobre a cidade de Oumi. De acordo com a lenda, a cada trezentos anos, Orochi reencarna em um vaso humano — e acredita-se que este é o prenúncio de uma catástrofe iminente. Enquanto vários grupos se chocam em busca do navio de Orochi, alguns pretendem selar a maldição, enquanto outros têm planos mais obscuros em movimento.