A Academia Cross é frequentada por dois grupos de estudantes: A Day Class e a Night Class. Quase sempre quando os estudantes da Day Class retornam aos seus dormitórios, eles cruzam o caminho com a Night Class, em direção a sua aula. Yuki Cross e Zero Kiryu são os guardiões da escola, eles evitam que os alunos da Day Class descubram o segredo negro da Academia: Que a Night class é um grupo de vampiros. A memória mais recente de Yuki é uma tempestade de neve, aonde ela foi atacada por um vampiro. E então salva por outro. Agora dez anos após, Yuki Cross, filha adotada do Diretor da Academia Cross, cresceu e se tornou a guardiã da escola, protegendo o segredo dos vampiros, e o segredo de seu salvador, Kaneme. Mas também há Zero Kiryu, um amigo de infância, que odeia os vampiros, pois eles destruíram tudo o que ele possuía, e então ele se torna determinado a nunca confiar em um vampiro. Esse clima coexistente parece bem, mas os vampiros realmente teriam renunciado a sua natureza? Ou existe uma verdade negra por trás de suas ações?